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高温烧菌培养室温度太高，杂菌易生长；发菌期菌袋内温度升至32弋以上，没及时疏袋散热，造成烧袋，致使绿霉等杂菌严重感染。培菌时有两个升温关键期，一是菌种萌发覆盖料面后的迅速生长期；二是早春气温迅速升高。高温烧菌后，病害症状没及时表现出来，但由于灵芝菌丝受损严重，芝棒割袋下地后，病害很快爆发。芝棒菌丝体成熟度不足灵芝菌丝体成熟度不足，菌丝体抗性弱，芝棒下地、菌袋剪口后仍易感染杂菌。阳光暴晒菌袋菌袋覆土后，日照强烈，迅速升温，芝棚遮阳度小（甚至没有遮阳），致使菌袋菌丝体被太阳暴晒受损后感染杂菌。芝棒下地后灌水由于是不完全脱袋栽培，芝棒下地后灌水，菌木表面及菌袋内的水份不能很快从袋内蒸发出来，过高的土壤水份会切断段木菌丝的氧气供给，致使芝棒呼吸不畅窒息死亡后感染杂菌。

《宋史》中写到及至南宋庆元五年八月，“太室西北夹室楹生白芝四叶，前史以白芝为丧祥”，似乎像被命运安排好一样“明年八月，国连有大丧”。灵芝在早期文献记载中的明确考证第1个是从《神农本草经》考证。《神农本草经》是中国现存部完整的药物学著作，它集合了很多医学著作，创作于公元前，总结了汉代以前的所有的药物学知识。第2个是《神农本草经》中将灵芝分为上、中、下三种，《神农本草经》中记载的上品灵芝多达120种，长时间服用能够使身体轻盈，血气充足，进而达到，而中品也有120种，能够治疗疾病，补气养血。下品有125种，能够去除寒气，疏络筋脉，可以作为辅药。总计记载的灵芝有365种。其中上品的灵芝中有不少学名：赤芝、黑芝、青芝、白芝、黄芝、紫芝。《神农本草经》中还对上述的6种灵芝进行了详细描述。与当代的各类医学著作进行比较，我们可以清楚地发现，《神农本草经》对灵芝的药物性质、主要治疗的疾病的描述，相差不大。这与魏朝和晋朝之后的医药专家以严谨的态度看待被神化的芝草有关。其中这6种灵芝的药效在现代医学验证下也已经得到了很明确的验证。因此，所载六芝的药效被古今药物学家不断地验证，《神农本草经》中的六芝与现代医学中的灵芝很相近。

袋栽与瓶栽过程相似，只是采用聚乙烯或聚氯乙烯塑料袋，装至离袋口约10cm处，收拢袋口，套塑料套环，加棉塞。灭菌，在无菌条件下接种培养。当菌丝长到袋的1/2左右时拔去棉塞和套环，露出料面，让其出芝。注意不要过早打开袋口，以免菌丝干涸而影响子实体发生。段木栽培选择栎树、榆树、桦木等阔叶树种，树龄7~10年，树径6~15cm。砍伐截段伐树在落叶后至翌年萌芽前进行，砍伐时不要损伤树皮。接种前锯成段，浸水12?15h，增加含水量，以利发菌。打孔接种用皮带冲安装在接种锤上打孔，直径约9.6?10mm，随即用接种枪接入菌种，然后用树皮盖封穴，接种选晴天进行，做到边打孔，边接种，边封穴。